1 样子不同：块根是由侧根、不定根发育而成，肥大成块状或纺缍状；块茎肉质肥大呈不规则块状，有较短而明显的节和节间。
2 定义不同： 块根是由营养繁殖的植株不定根或实生苗侧根膨大形成的，一株上可形成多个块根，它的组成不含下胚轴和茎的部分，完全由根构成，甘薯、何首乌的块根都属此类。 块茎(tuber)是植物学名词术语。它是植物茎的一种变态，呈块状，故名。既然是茎，因此就具有植物茎的主要特征，比如芽、叶痕等。
3 品种不同： 块根：药用块根还有天门冬、郁金香、百部等。 块茎：根系自块茎底部发生，节向下凹陷如眼窝，芽生其中但并不明显，鳞叶退化或早落，如半夏、天麻、马铃薯等。
如何区分块茎和块根？
块根和块茎外观不同，块根比较肥大呈块状或者纺锤状；块茎是底下变态茎的移栽，呈不规则块状，并且有明显的节和节点。另外，块根是有侧根或不定根局部膨大而成，它与肉质直根的来源也不相同，因此一个植株上可以在多条侧根或不定根上形成多个块根。
